反吹清灰制度有“二状态”（过滤-清灰）或“三状态”（过滤-清灰-沉降）之分。
二状态清灰是使滤袋交替地缩瘪和鼓胀的过程，通常进行两个缩瘪和鼓胀过程。缩瘪时间和鼓胀时间各为10-20s。
三状态清灰的提出，主要考虑长5-10m的滤袋清灰时，粉尘尚未全部落入灰斗便恢复过滤，部分粉尘再次被吸附于滤袋表面，削弱清灰效果，滤袋越长，这种现象越明显。于是在二状态清灰的基础增加一个“沉降”状态，此时烟气阀门和反吹阀门都被关闭，滤袋处于静止状态，使清离滤袋的粉尘有较多的机会沉降到灰斗内。
三状态清灰制度又有集中沉降和分散沉降两种。集中沉降是在完成数个二状态清灰后，集中一段时间，使粉尘沉降，持续时间一般为60-90s。分散沉降是在每次胀缩后，安排一段静止时间，使粉尘沉降，其持续时间一般为30-60s。
除尘器的反吹清灰由程序控制器进行控制。传统的控制方式为定时控制，现在已出现分室定压差控制方式，即每一室装设一个微差变送器。控制器巡回检测各袋室的压差，当某个袋室的压差达到限定值时，控制器便发出信号，使该室的阀门切换而开始清灰，直到清灰结束，恢复过滤状态。
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